监理工程师检查了承包商的隐蔽工程，并按合格签证验收。但是事后再检查发现不合格。承包商认为：隐蔽工程监理工程师已按合格签证验收，现在却断为不合格，是监理工程师的责任造成的。承包商向监理工程师提出工期费用索赔报告。业主代表认为监理工程师对工程质量监理不力，提出要扣监理费1000元。
问题：监理工程师怎样处理索赔报告?监理工程师承担什么责任?承包商承担什么责任?业主承担什么责任。